论文查重软件作为评估论文创新性的工具，有多种方法。首先，它可以通过比对已有文献和网络资源，检测论文中的重复内容，从而初步评估论文的创新性。其次，一些高级查重软件还能分析论文的结构、论点和思路，与已有文献进行对比，判断论文在观点上是否具有独创性。此外，一些查重软件还会对论文的语言风格、用词方式进行分析，从而进一步评估其创新性。总体来说，论文查重软件在评估论文创新性时，结合了文本相似度比对、语言特征分析等多种方法，以全面客观的方式对论文进行评价。

除了使用论文查重软件外，评估论文创新性还可以采用其他方法。例如，可以邀请专业领域的学者或专家进行评审，他们会根据自己的经验和知识，从学术角度评价论文的创新性。此外，还可以组织讨论会或学术研讨会，邀请同行对论文进行评议，从不同角度获取评价意见。另外，一些学术期刊或会议也会设立专门的评审委员会，对投稿的论文进行严格评审，其中包括创新性的评价。综上所述，评估论文创新性的方法有多种，论文查重软件只是其中之一，在实际评估过程中，可以根据具体情况选择合适的方法。